Ursprüng­lich teil­te sich die Oder nörd­lich Oder­bergs in zwei Haupt­ar­me, von wel­chen der grö­ße­re, Oder genannt, am west­li­chen Tal­rand über Lunow, Stol­pe und Crie­wen bis Schwedt lief, wäh­rend der zwei­te Haupt­arm, die Meg­lit­ze, am öst­li­chen Höhen­ran­de über Hohen­wut­zen, Zeh­den (Cedy­nia), Bel­lin­chen (Bie­li­nek) und Peet­zig (Pia­sek) nach Nie­der­saa­ten (Zatoñ Dol­ny) führ­te. Unter­halb von Schwedt und von Nie­der­saa­ten ver­än­der­ten und ver­äs­tel­ten sich die bei­den Haupt­ar­me. Nörd­lich von Gartz und von Grei­fen­ha­gen (Gry­fi­no) waren wie­der zwei Haupt­ar­me zu erken­nen, von denen die Oder am West­ran­de über Gartz und Stet­tin (Szc­ze­cin) in das Papen­was­ser führ­te, die Reg­litz am Ost­ran­de in den Damm­schen See ein­mün­de­te. Bei­de Haupt­ar­me waren durch zahl­rei­che Zwi­schen­ar­me mit­ein­an­der verbunden.

Ziel der was­ser­bau­li­chen Maß­nah­men vom 19. zum 20. Jahr­hun­dert war nun die Her­stel­lung und Instand­hal­tung eines tie­fen, leis­tungs­fä­hi­gen Strom­schlau­ches bis in das natür­li­che Auf­nah­me­be­cken, den Damm­schen See. Damit soll­te der Schiff­fahrts­weg ver­tieft, ver­kürzt, begra­digt und jeder­zeit befahr­bar gemacht wer­den. Dar­über hin­aus soll­ten Sand­ab­la­ge­run­gen ver­hin­dert, der Abfluss des Hoch­was­sers beschleu­nigt und die Vor­flut für das Oder­bruch ver­bes­sert wer­den. Nicht zuletzt auf aus­drück­li­chen Wunsch der Wie­sen­be­sit­zer, die auf die reich­lich Dün­gung mit sich füh­ren­den Win­ter­hoch­wäs­ser nicht ver­zich­ten woll­ten, soll­te das Gebiet von Win­ter­hoch­wäs­sern unein­ge­schränkt über­flu­tet wer­den können.

Zur Rea­li­sie­rung des Groß­schiff­fahrts­we­ges Ber­lin – Stet­tin, also für eine kon­ti­nu­ier­li­che Nut­zung durch Schif­fe mit einer Trag­fä­hig­keit von 600 t, und als Vor­flu­ter des Oder­bru­ches wur­de die Hohen­saa­ten-Fried­richs­tha­ler-Was­ser­stra­ße geschaf­fen, die süd­lich von Schwedt das alte Oder­bett nutz­te, wäh­rend nörd­lich von Schwedt ein Kanal­durch­stich erfor­der­lich war. Die Ostoder, also die ehe­ma­li­ge Meg­lit­ze und heu­ti­ge Stro­mo­der, soll­te als Haupt­strom die aus dem Oder­lau­fe kom­men­den Was­ser­men­gen und die Schweb­stof­fe auf dem schnellst­mög­li­chen Weg in den Damm­schen See füh­ren. Die Som­mer­dei­che west­lich der Ostoder soll­ten dazu die­nen, das Was­ser aus dem Ober­lauf in geschlos­se­nem Quer­schnitt bis zu einer Was­ser­füh­rung von 1.600 m³/sec. zusam­men­zu­hal­ten. Erst bei einer grö­ße­ren Was­ser­füh­rung soll­te eine Über­flu­tung des Pol­der­ge­bie­tes ein­tre­ten. Sobald der Was­ser­stand an der Ostoder zurück­ging, soll­te eine schnel­le Abtrock­nung des Pol­der­ge­bie­tes zu der tie­fer­ge­le­ge­nen Hohen­saa­ten-Fried­richs­tha­ler Was­ser­stra­ße und zur Wes­t­oder hin erfol­gen. Um unab­hän­gig vom wech­seln­den Was­ser­stand der Oder einen ganz­jäh­rig befahr­ba­ren Groß­schiff­fahrts­weg und eine gesi­cher­te Vor­flu­tung des Oder­bru­ches zu gewähr­leis­ten, wur­de die Hohen­saa­ten-Fried­richs­tha­ler Was­ser­stra­ße durch ein Wehr bei Hohen­saa­ten und eine Schleu­se an der Schwed­ter Quer­fahrt von der zum Haupt­strom aus­ge­bau­ten Ostoder abge­kop­pelt. Sie ist ledig­lich nach Nor­den zur Wes­t­oder offen, die aber über das Mari­en­ho­fer Wehr bei Fid­di­chow (Widucho­wa) eben­falls vom Was­ser­lauf der Ostoder abge­trennt wur­de. Über die­ses Wehr kön­nen aber bis zu 650 m³/sec. in die Wes­t­oder gelei­tet wer­den, sobald die Ostoder eine Gesamt­ab­führ­men­ge von 1.600 m³/sec. erreicht hat. Am Hohen­saa­te­ner Wehr kön­nen bis zu 20 m³/sec. aus der Stro­mo­der in die Hohen­saa­ten-Fried­richs­tha­ler Was­ser­stra­ße ein­ge­lei­tet wer­den, um den Was­ser­stand zu regulieren.

Zwi­schen der Hohen­saa­ten-Fried­richs­tha­ler Was­ser­stra­ße und der Stro­mo­der im Süden und der Ost- und der Wes­t­oder im Nor­den wur­de ein von Hol­län­dern geplan­tes Pol­der­sys­tem ein­ge­rich­tet. Wäh­rend der süd­li­che Tro­cken­pol­der bei Lunow und Stol­pe durch Dei­che ganz­jäh­rig vor einer Über­flu­tung geschützt wird, ver­fügt der nörd­lich anschlie­ßen­de Nass­pol­der im öst­li­chen Som­mer­deich, im west­li­chen Win­ter­deich und in den Dei­chen zur Schwed­ter Quer­fahrt über zahl­rei­che Ein­lass- und Aus­lass­bau­wer­ke, die als  Sie­le und Schleu­sen aus­ge­baut sind. Auf deut­scher Sei­te wer­den die Nass­pol­der (5.400 ha) im Win­ter über Ein­lass­bau­wer­ke im Som­mer­deich von Nor­den begin­nend zwi­schen dem 15. Novem­ber und dem 15. Dezem­ber eines jeden Jah­res geflu­tet. Im Zeit­raum vom 15. März bis zum 15. April wer­den die Deich­to­re wie­der geschlos­sen, das Was­ser fließt ent­spre­chend dem Gefäl­le in die Hohen­saa­ten-Fried­richs­tha­ler Was­ser­stra­ße, in die Schwed­ter Quer­fahrt und in die Wes­t­oder, oder es wird mit Hil­fe der Schöpf­wer­ke abge­pumpt, um die Pol­der früh­zei­tig land­wirt­schaft­lich nut­zen zu kön­nen. Som­mer­hoch­was­ser, die eben­falls zu einer Flu­tung füh­ren, tre­ten nur sel­ten auf, in der Regel ein­mal im Jahr­zehnt. Der Som­mer­deich west­lich der Stro­mo­der ist unter­halb von Crie­ort auf einer Län­ge von 800 m als Über­lauf­stre­cke aus­ge­bil­det. Er wird bei Hoch­was­ser über­spült, wenn die Kapa­zi­tät der Ein­lass­bau­wer­ke nicht ausreicht.

Die aus­ge­dehn­ten Über­flu­tungs­flä­chen im unte­ren Oder­tal haben sich nicht nur als Flä­chen­fil­ter, son­dern auch als wirk­sa­mer Hoch­was­ser­schutz bewährt, nicht zuletzt bei dem Jahr­hun­dert­hoch­was­ser im Som­mer 1997. Im Juli war es in Mäh­ren und Ober­schle­si­en inner­halb von 10 Tagen zwei­mal zu schwe­ren Regen­fäl­len gekom­men. Beim ers­ten Mal waren dort 8–10 Mil­li­ar­den m³, beim zwei­ten Mal 4–5 Mil­li­ar­den m³ Regen her­un­ter­ge­kom­men. Dadurch hat­te die Oder statt der übli­chen 400 m³/sec. die sechs­fa­che Was­ser­men­ge zu trans­por­tie­ren. Der Pegel­stand bei Hohen­saa­ten erreich­te am 31. Juli einen Höchst­stand von 7,29 m. Anders als am Ober­lauf der Oder in Mäh­ren und Schle­si­en, wo ent­spre­chen­de Über­flu­tungs­flä­chen weit­ge­hend feh­len, kam es im unte­ren Oder­tal zu kei­nen nen­nens­wer­ten Schä­den. Die Hoch­was­ser­spit­ze wur­de von der weit­läu­fi­gen Auen­land­schaft des unte­ren Oder­ta­les auf­ge­nom­men, das Oder­bruch und strom­ab­wärts Stet­tin (Szc­ze­cin) vor Über­flu­tung geschützt.

Im Abschluss­be­richt der bran­den­bur­gi­schen Lan­des­re­gie­rung vom 31. März 1998 wur­den die Hoch­was­ser­schä­den mit 648 Mio. DM bezif­fert. Sol­che soge­nann­ten Jahr­hun­dert­über­flu­tun­gen kön­nen sich künf­tig nach Auf­fas­sung der Bun­des­an­stalt für Gewäs­ser­kun­de in Koblenz häu­fi­ger wie­der­ho­len. Im Rah­men der Kli­ma­er­wär­mung wird bis zum Jah­re 2030 die glo­ba­le Tem­pe­ra­tur  um rund zwei Grad stei­gen und dadurch die Regen­men­ge in Deutsch­land um 100 l/m² pro Jahr zuneh­men. Die was­ser­bau­li­chen Anla­gen und das Pol­der­sys­tem erfor­dern für ihre Unter­hal­tung einen hohen per­so­nel­len und finan­zi­el­len Auf­wand. Das zustän­di­ge bran­den­bur­gi­sche Umwelt­mi­nis­te­ri­um geht von min­des­tens 800 TDM jähr­li­chen Unter­hal­tungs- und Betriebs­kos­ten aus.

Das Pol­der­sys­tem wur­de in einer Zeit geschaf­fen, in der jeder Qua­drat­me­ter bebau­ba­res Land für die Land­wirt­schaft benö­tigt wur­de. Nur ein klei­ner Teil der was­ser­bau­li­chen Anla­gen ist für die Siche­rung der inter­na­tio­na­len Was­ser­stra­ße zwi­schen Ber­lin und Stet­tin und für den Hoch­was­ser­schutz erfor­der­lich, was sich schon dar­an zeigt, dass die kom­pli­zier­te Pol­der­wirt­schaft im Gart­zer und im Schil­lers­dor­fer Pol­der seit 1945 ein­ge­stellt wur­de. Unver­zicht­bar bleibt bei­spiels­wei­se der Win­ter­deich öst­lich der Hohen­saa­ten-Fried­richs­tha­ler Was­ser­stra­ße. Die meis­ten ande­ren Anla­gen, ange­fan­gen bei dem die Stro­mo­der west­lich beglei­ten­den Som­mer­deich bis hin zu den war­tungs- und pfle­ge­auf­wen­di­gen Ein­lass- und Aus­lass­bau­wer­ken, den Schöpf- und Pump­wer­ken und der Krau­tung der Grä­ben, sind im Grun­de genom­men zusätz­li­che Sub­ven­ti­ons­maß­nah­men für die ört­li­che Landwirtschaft.

Auf deut­scher Sei­te waren die was­ser­bau­li­chen Anla­gen wäh­rend der DDR-Zeit zwar betriebs­be­reit, aber lan­ge nicht grund­le­gend instand­ge­setzt und erneu­ert wor­den. Nach einer zumin­dest in Umwelt­krei­sen geführ­ten Dis­kus­si­on, ob es über­haupt sinn­voll sei, die Ein- und Aus­lass­bau­wer­ke nach der Grün­dung eines Auen­na­tio­nal­parks noch zu erneu­ern, wur­den – da Geld in Deutsch­land ja kei­ne Rol­le spielt – nach und nach alle Ein- und Aus­lass­bau­wer­ke völ­lig neu und modern gebaut, auch wenn sie per­spek­ti­visch viel­leicht gar nicht mehr genutzt wer­den. Immer­hin las­sen sich so bei über­ra­schen­den Früh­lings- oder Som­mer­hoch­was­sern die Pol­der vor Über­flu­tung schüt­zen. Aber eigent­lich ist die­se Mil­lio­nen­in­ves­ti­ti­on ziem­lich sinn­los aus­ge­ge­ben worden.

Spä­tes­tens nach dem Som­mer­hoch­was­ser 1997 wur­de beschlos­sen, alle Win­ter- und auch Som­mer­dei­che zu erhö­hen und zu ver­brei­tern, obwohl sie wäh­rend die­ses spek­ta­ku­lä­ren Hoch­was­ser­er­eig­nis­ses im Natio­nal­park­be­reich nicht gefähr­det waren. Für den Win­ter­deich öst­lich der Hohen­saa­ten-Fried­richs­tha­ler Was­ser­stra­ße macht das aus Hoch­was­ser­schutz­grün­den für die Bevöl­ke­rung west­lich der Hohen­saa­ten-Fried­richs­tha­ler Was­ser­stra­ße viel­leicht Sinn, ist aber bei der Ertüch­ti­gung und Unter­hal­tung der Som­mer­dei­che ziem­lich sinn­los. Die sind sogar für einen wirk­li­chen Auen­na­tio­nal­park eher hin­der­lich. Blei­ben die Ein- und Aus­lass­bau­wer­ke ganz­jäh­rig offen, wird ihre, den natür­li­chen Auen­pro­zess stö­ren­de Wir­kung aller­dings etwas reduziert.

Im Ergeb­nis wur­den alle was­ser­bau­li­chen Anla­gen im unte­ren Oder­tal in den letz­ten 25 Jah­ren seit der Wie­der­ver­ei­ni­gung auf den neu­es­ten tech­ni­schen Stand gebracht.

Auf der pol­ni­schen Sei­te wur­de die Pol­der­be­wirt­schaf­tung bereits nach Kriegs­en­de ein­ge­stellt. Polen ver­füg­te auch ohne die Pol­der­flä­chen über aus­rei­chend land­wirt­schaft­li­che Nutz­flä­chen. Zwar sind die Som­mer­dei­che des Zwi­scheno­der­lan­des größ­ten­teils noch erhal­ten, die Ein- und Aus­lass­bau­wer­ke und die Schleu­sen dage­gen nicht mehr funk­ti­ons­tüch­tig. Sie ste­hen dem natür­li­chen Über­flu­tungs­ge­sche­hen ganz­jäh­rig offen.

Die Zustän­dig­kei­ten im Bereich der Was­ser­wirt­schaft des unte­ren Oder­tals sind kom­pli­ziert. Neben dem Bun­des­was­ser­stra­ßen- und Schiff­fahrts­amt in Ebers­wal­de sind das Lan­des­um­welt­amt, Abtei­lung Gewäs­ser­schutz und Was­ser­wirt­schaft, die Unte­re Was­ser­be­hör­de der bei­den betrof­fe­nen Krei­se Ucker­mark und Bar­nim und der Was­ser- und Boden­ver­band „Wel­se“ zuständig.